Als Vertreterin der zeitgenössischen Musik hat Nina Assimakopoulos mehr als 50 internationale Uraufführungen und Kompositionsaufträge sowie multimediale Kooperationsprojekte und Konzerte vorzuweisen, bei denen sie barocke bis zeitgenössische Flötenmusik mit visueller und digitaler Kunst, Tanz und Theater verbindet.
Zu den Höhepunkten ihrer Karriere zählen ihr New Yorker Solodebüt in der Carnegie Hall, Solokonzerte bei der „Rising Stars“-Konzertreihe des Alden Theaters in Washington, D.C., die „Dame Myra Hess Radio Broadcast Concert Series“ in Chicago, die „Live from Hochstein“-Radioübertragungskonzertreihe in Rochester, New York, und das AmBul New Music Festival in Sofia, Bulgarien.

Sie spielte als Soloflötistin mit der Münchner Oper, dem Symphonieorchester des Bayerischen Rundfunks, dem New Hampshire Symphony Orchestra und dem Toledo Symphony Orchestra. Assimakopoulos erhielt zahlreiche Stipendien und Auszeichnungen, darunter den Aaron Copland Fund Grant for New Music Recording, zwei Fulbright-Stipendien, den National Society of Arts and Letters Career Award, die Yehudi Menuhin Chamber Music Endowment und das Meisterklasse-Zertifikat der Münchner Musikhochschule.

Zu ihren Soloaufnahmen gehören Flute Impressions, Arcadian Murmurs und Points of Entry, Works for Solo Flute by American Women Composers, Volumes I und II, erschienen bei Capstone Records und Euterpe Recordings. Ihre fünfte CD, Chrome, soll 2012 erscheinen.
Als gefragte Lehrerin hat Nina Assimakopoulos Meisterkurse gegeben und Auftritte an der Eastman School of Music, der Arizona State University, der University of North Texas, der University of Illinois in Champagne-Urbana, der University of Colorado, Boulder, der University of Michigan, der Michigan State University, dem Flute Festival Mid-South, dem Great Lakes Flute Festival und der National Music Academy in Sofia, Bulgarien, gegeben. Ihre Schüler waren Finalisten und Preisträger bei zahlreichen Wettbewerben, darunter der Fischoff-Wettbewerb und die Wettbewerbe der National Flute Association, der Rochester Flute Association, der Southeast Michigan Flute Association, der Mid-Atlantic Flute Association, der Oklahoma Flute Association und der Kentucky Flute Association Young Artist Competitions.

Sie ist Flötenprofessorin an der West Virginia University, wo sie jährlich das fünftägige Internationale Flötensymposium veranstaltet, das neben dem größten Angebot an Workshops und Meisterkursen aller Flötensymposien des Landes auch die meisten renommierten Flötisten aufbietet. Zuvor war sie an den Fakultäten des Houghton College und der Bowling Green State University tätig.

Neben ihrer Arbeit als Musikerin ist Assimakopoulos auch eine preisgekrönte Malerin, deren Werke in Museen und bei internationalen Jurys ausgestellt wurden. Nina Assimakopoulos studierte bei Peter Lloyd an der Indiana University School of Music und bei Paul Meisen an der Münchner Musikhochschule und ist Altus Performing Artist.